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原标题:多组学(Multi-omics)整合研究思路及案例分享 多组学(Multi-omics)研究是探究生物系统中多种物质之间相互作用的方法,包括基因组学、表观基因组学、转录组学、蛋白质组学、代谢组学、微生物组学等,这些物质共同影响生命系统的表型、性状等。 随着高通量测序技术的发展,组学(Omics)研究不断深入,通过对各组学进行高通量测序并对数据整合研究,可以全面和系统地了解基础研究、分子育种、临床诊断和药物研发等领域中多种物质的相互关系。为网络生物学、系统生物学的研究提供重要的技术手段。 为便于对多组学研究思路的理解,我们将近期发表的经典多组学文章进行整理。 1 基因组、外显子组、转录组测序在临床癌症基因组学中的研究 Clinical cancer genomic profiling by three-platform sequencing of whole genome, whole exome and tranome 研究思路:对78例临床肿瘤样本,通过基因组、外显子组、转录组测序,对基因结构进行研究,找到与肿瘤相关的结构变异(structure variation,SV)、体细胞突变、致病性突变等。 2 微生物次生代谢产物生物合成的多组学研究 Omics and multi-omics approaches to study the biosynthesis of secondary metabolites in microorganisms 研究思路:利用基因组学、转录组学、蛋白质组学和代谢组学的方法,开发天然代谢产物。基因组学,挖掘天然产物的生物合成基因;转录组学,代谢通路分析;蛋白质组学,代谢通路分析;代谢组学,代谢通路分析、天然产物新家族的发现。具体研究思路见下图。 3 疾病的多组学研究方法 Multi-omics approaches to disease 研究思路:本文为综述类文章,阐述多组学在疾病中的研究思路,包括基因组、表观基因组、转录组、蛋白质组、代谢组、微生物组学的整合及各组学的相互关系。除基因组外,其它的组学都反映了遗传调控和环境的关系,这可能在不同程度上影响到每个组学的特定物质。各组之间会频繁发生交互作用。此外,利用多组学研究,可对GWAS突变进行优先级排序。
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